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首先需要解決的瓶頸問題是毫秒內的等壓分離，因此， sciex在2009年推出了 selexion?差分離子同位素技術，納升級流速消耗品代理，這是 sciex和俄羅斯科學家共同努力的結果，它是質譜系統整體的一部分，而不是液相系統的一部分。為使 selexion差分分離子同位度技術充分發揮其商業潛力，還有五個問題需要解決。
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另外三個瓶頸突破是如何將樣品傳送到質譜系統。采用開放探頭(open port probe， opp)技術傳送樣品，完全可以替代在液相色譜中必須使用的開關閥，自動取樣器，高壓泵和復雜的管道系統，從而簡化了整個液相流道。與此同時， opp還提供在線樣品稀釋和連續自清潔功能，從而解決了樣品預處理和系統交叉污染問題。這項技術是基于2008年 sciex與橡樹嶺國家實驗室(oak ridge national lab)簽訂的一項合作研究協定的成果，該協議也是一個*的模型，人們對它寄予厚望。
opp也提供了一種解決進樣速度和高密度樣品格式的方案。通過對 opp的設計和改進，實現了利用聲波激勵實現樣品的、傳遞功能。拉布西特和 edc已經開發出基于聲波激勵的微孔板， sciex也正在與兩家公司合作探索這一應用。sciex和 labcyte公司當時在 sciex的紅木城廠(redwood city facility)進行了一次使用 opp的聲波激勵進樣試驗。
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電噴離子化， esi應用廣泛，適用于*性稍小的化合物的分析，也適用于肽類、蛋白質類大分子的分析， esi源的優點有：離子化1，適用于熱不穩定化合物的分析，與液相色譜、毛細管電泳等聯用，與液相聯用時要注意流動相的流速在0.3~0.6 ml/min左右，適合于常規 hplc柱的佳流速為1 ml/min的色譜柱后分流，或增加霧化氣體的流速。
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有的化合物穩定性較差， ei法不易獲得分子離子，因此也就無法獲得分子量。分子質量可采用 ci離子化方式獲得。在結構上， ci與 ei并無太大區別。或主要部分是共享部分。不同之處主要在于 ci源在工作過程中引入了反應氣。反應氣有，*，氨等。反應性氣體的量遠遠大于樣品氣體。由絲狀物發出的電子首先將反應氣體電離，然后反應氣體離子與樣品分子發生離子化和離子化反應。
用正離子束來轟擊工質，可以得到工質的負離子。若在一個周期表第ⅳ族之后，用銫離子束去濺射電子親合力大的元素，納升級流速消耗品，則可以得到該元素微安級的負離子束流。若氫或 ya離子束穿過充滿工作物質的氣孔，則可獲得數個微安的負離子束。對于重離子加速系統，采用組合加速方法，由前級將低電荷狀態的重離子加速到兆電子伏特每核的能量，并通過固態剝離膜或氣體剝離器將部分軌道電子剝離，使其在主上繼續加速，在主上則能獲得更高的能量增益。由*和剝離器組成的復合加速系統，可以被認為是一類特殊的重離子源系統。
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直線型離子阱技術： sciex直線型離子阱(lit)技術在同一體系中，可以獲得定量和定性的性能。采用四*桿質譜計作為線性離子阱，可提高離子容量，提離子注入和捕獲效率，納升級流速消耗品價格，提高占空比，從而顯著提高提離子阱的性能。借助 api 4000系統的靈敏度，4000 qtrap系統結合了 lit三重四*桿儀器，構建了可用于 yao物發現、蛋白質組學和多目標分析的系統。
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整合系統：4000 qtrap系統與實驗室工作流程相結合，提高您的發現效率。與我們的分析軟件相結合，該系統可以簡化方法開發、數據采集和處理，包括主流 lc平臺的動態控制。這個系統可以被配置成支持21 cfr part 11的一致性。該系統采用即插即用型離子源設計，適用范圍廣，速度范圍廣。你也可以在這個系統上使用很多應用軟件，包括： discoveryquant軟件， lightsight軟件， lipidview軟件，納升級流速消耗品廣東總代理， markerview軟件， mrmpilot軟件， multiquant軟件， proteinpilot軟件， bioanalyst軟件，碎片分析軟件，繪圖庫搜索軟件和自動化軟件。這樣你就可以從每一個樣本中得到比在其它單一系統中分析更多的有用信息。
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